La tuberculosis (TB) es una amenaza para la salud global y reemergente que afecta a un tercio de la población mundial. Conocer los mecanismos de la patogénesis, virulencia y persistencia de la infección por Mycobacterium tuberculosis (MTb) permitirá hacerle frente de manera más eficiente.
Los socios del proyecto «Systems biology of Mycobacterium tuberculosis» (
SYSTEMTB),
financiado con fondos europeos, desarrollaron un método conceptual
basado en la biología de sistemas para llevar a cabos estudios basados
en modelos del agente causante, el bacilo MTb. Es necesario entender las
interacciones del MTb con el huésped para desarrollar estrategias
novedosas y rentables para combatir la TB.
El proyecto SYSTEMTB generó conjuntos de datos cuantitativos del MTb que describían la transcriptómica, proteómica, metabolómica, genómica estructural, lipidómica y glicómica. Se desarrollaron modelos informáticos, poniendo especial énfasis en el metabolismo, las redes reguladoras y la regulación de la transcripción.
La identificación de nuevas dianas posibles para la intervención terapéutica basada en modelos informáticos fue una parte importante del proyecto. Estos métodos proporcionan un marco racional para comprender la fisiología micobacteriana durante la infección.
El proyecto permitió la comprensión avanzada de las interacciones físicas, estructuras, funciones y localizaciones de las proteínas del MTb. Una base de datos de la página web del proyecto SYSTEMTB permite a la comunidad científica acceder fácilmente a la biblioteca de MTb marcados por fluorescencia. La base de datos integra los clones de MTb con sus imágenes de localización de la proteína. Se amplificaron y entregaron más de dos mil clones de la biblioteca a los miembros del consorcio.
Se publicaron varios recursos como resultado del proyecto. Así, la base de datos PeptideAtlas es hasta la fecha la colección más exhaustiva de bases de datos proteómicas del bacilo MTb. La base de datos SRMAtlas contiene espectrometrías de masas del proteoma completo del MTb. La base de datos PASSEL contiene pruebas experimentales de cada proteína identificada por ensayos de monitorización selectiva de reacción (SRM) depositadas en la base de datos SRMAtlas.
Como resultado del proyecto SYSTEMTB, se generó un modelo basado en la restricción genómica del metabolismo y transporte del MTb. Este modelo es actualmente el más completo del metabolismo del MTb con 1 179 reacciones, 874 genes y el 83 % de las reacciones con una asociación genética. La clave del éxito del proyecto SYSTEMTB fue la integración de la bioinformática y los estudios estructurales y funcionales.
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