Los genes responsables de la artritis

Por medio de estudios de asociación de genoma completo, los investigadores identificaron regiones del genoma que incrementan la susceptibilidad a padecer RA pero no los genes verdaderamente responsables. Esto es debido a la complejidad para asociar con precisión genotipo y fenotipo en la RA, así como en otras enfermedades autoinmunes.

La proteína 3 inducida por el factor de necrosis tumoral alfa (TNFAIP3) regula de manera negativa el NF-kappaB y ayuda a inhibir los efectos del receptor TNF que media en la señalización celular. El concepto de región intergénica (IGR) hace referencia a un conjunto de secuencias de ADN localizadas entre genes. La IGR localizada hacia el extremo 5' del gen que codifica para la TNFAIP3 se vinculó con enfermedades autoinmunes como la RA, la diabetes tipo 1, la enfermedad inflamatoria intestinal y el lupus eritematoso sistémico.

El proyecto GENTOPHEN se centró en la identificación de las variantes genéticas en el locus TNFAIP3 que incrementan la susceptibilidad a padecer RA. Los investigadores emplearon técnicas punteras incluyendo la bioinformática, ensayos de cambios de movilidad electroforética, la inmunoprecipitación de cromatina y una versión de la técnica de captura de la conformación cromosómica modificada para este propósito.

Los resultados pusieron de manifiesto que la variante genética rs6927172 en el loci TNFAIP3 está implicada en la desregulación de la expresión del gen que codifica para la TNFAIP3. Esto sugiere que existe una alta probabilidad de que la variante rs6927172 contribuya a la patogénesis de la RA.

En conjunto, las actividades del proyecto GENTOPHEN condujeron a la mejora de técnicas que van más allá del actual nivel de desarrollo en el campo de la genética de enfermedades complejas. Estas técnicas podrían ayudar a determinar no solo la etiología que subyace a la RA, sino también a otras enfermedades complejas.