Coordinar la investigación sobre el microbioma humano

Nuestros cuerpos contienen miles de especies diferentes de bacterias, que en conjunto superan en número a las células humanas. Su impacto en la fisiología, la inmunidad y la nutrición es indiscutible, pero al mismo tiempo es muy complejo.

La determinación de las comunidades microbianas presentes en los seres humanos ha sido el objeto de estudio de muchos proyectos de investigación. Sin embargo, se necesitan protocolos estandarizados para comparar datos entre estudios y reducir la variabilidad. El objetivo del proyecto financiado por la Unión Europea «International human microbiome standards» (IHMS) es estandarizar los procedimientos de la investigación sobre el microbioma humano.

En este contexto, los grupos que forman parte del consorcio IHMS trabajarán en aras de comparar y optimizar los procedimientos y los protocolos estándar para la toma y la recolección de muestras, la secuenciación de genomas microbianos y el análisis de datos. Durante los primeros pasos del proyecto, los investigadores evaluaron las prácticas y metodologías de trabajo actuales de más de veinte grupos de investigación implicados en el estudio del metagenoma del tracto intestinal humano.

Con respecto a la toma y la recolección de muestras, los socios están optimizando varios parámetros que afectan a la calidad de la muestra, incluyendo el tiempo y la temperatura de recolección, el almacenamiento y el envío. Idealmente, las muestras recolectadas en casa deberían ser enviadas en el plazo de un día y preferentemente en condiciones de frío. Para evitar el deterioro derivado del crecimiento bacteriano a temperatura ambiente, el envío bajo condiciones anaerobias debería ser el método preferido. El método propuesto por los socios del proyecto IHMS para la toma y el envío de muestras garantiza la preservación de las especias microbianas para su análisis.

Hasta el momento, los socios del consorcio han secuenciado el ADN microbiano extraído de veinticuatro muestras de heces y han comparado la abundancia de cerca de tres millones de genes. Además de analizar y compilar estos datos, los investigadores también se proponen llevar a cabo un análisis filogenético por medio de la evaluación de la composición filogenética de cada muestra. Esto constituiría una herramienta de gran valor en aras de la caracterización de las comunidades microbianas.

La investigación del proyecto IHMS identificará cómo diferentes trasfondos genéticos, dietas y, en sentido más amplio, estilos de vida diferentes afectan a las comunidades microbianas más comunes del tracto intestinal. También ayudará a mejorar o restablecer la salud gracias al desarrollo de nuevos productos farmacéuticos para mejorar la eficacia de la microbiota endógena.