Nuestros cuerpos contienen miles de especies diferentes de bacterias,
que en conjunto superan en número a las células humanas. Su impacto en
la fisiología, la inmunidad y la nutrición es indiscutible, pero al
mismo tiempo es muy complejo.
La determinación de las comunidades microbianas presentes en los
seres humanos ha sido el objeto de estudio de muchos proyectos de
investigación. Sin embargo, se necesitan protocolos estandarizados para
comparar datos entre estudios y reducir la variabilidad. El objetivo del
proyecto financiado por la Unión Europea «International human
microbiome standards» (
IHMS) es estandarizar los procedimientos de la investigación sobre el microbioma humano.
En este contexto, los grupos que forman parte del consorcio IHMS
trabajarán en aras de comparar y optimizar los procedimientos y los
protocolos estándar para la toma y la recolección de muestras, la
secuenciación de genomas microbianos y el análisis de datos. Durante los
primeros pasos del proyecto, los investigadores evaluaron las prácticas
y metodologías de trabajo actuales de más de veinte grupos de
investigación implicados en el estudio del metagenoma del tracto
intestinal humano.
Con respecto a la toma y la recolección de muestras, los socios
están optimizando varios parámetros que afectan a la calidad de la
muestra, incluyendo el tiempo y la temperatura de recolección, el
almacenamiento y el envío. Idealmente, las muestras recolectadas en casa
deberían ser enviadas en el plazo de un día y preferentemente en
condiciones de frío. Para evitar el deterioro derivado del crecimiento
bacteriano a temperatura ambiente, el envío bajo condiciones anaerobias
debería ser el método preferido. El método propuesto por los socios del
proyecto IHMS para la toma y el envío de muestras garantiza la
preservación de las especias microbianas para su análisis.
Hasta el momento, los socios del consorcio han secuenciado el ADN
microbiano extraído de veinticuatro muestras de heces y han comparado la
abundancia de cerca de tres millones de genes. Además de analizar y
compilar estos datos, los investigadores también se proponen llevar a
cabo un análisis filogenético por medio de la evaluación de la
composición filogenética de cada muestra. Esto constituiría una
herramienta de gran valor en aras de la caracterización de las
comunidades microbianas.
La investigación del proyecto IHMS identificará cómo diferentes
trasfondos genéticos, dietas y, en sentido más amplio, estilos de vida
diferentes afectan a las comunidades microbianas más comunes del tracto
intestinal. También ayudará a mejorar o restablecer la salud gracias al
desarrollo de nuevos productos farmacéuticos para mejorar la eficacia de
la microbiota endógena.
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