El estudio de nuevos grupos de microorganismos edáficos
Investigadores europeos han desarrollado un nuevo método para ayudar a caracterizar con precisión grupos de microorganismos edáficos.
Los microorganismos edáficos como las bacterias y los hongos descomponen
la materia orgánica vegetal (es decir, la celulosa presente en esta),
que es rica en carbono. Por tanto, estos desempeñan un papel importante
en el ciclo biogeoquímico del carbono en la Tierra; sin embargo, no se
conocen con detalle los factores que afectan a la diversidad y a la
actividad de estos microorganismos edáficos.
Tradicionalmente, con el objetivo de mejorar la comprensión de la
degradación de la celulosa, solo se estudiaba la pequeña proporción de
microorganismos edáficos que pueden ser cultivados en el laboratorio.
Pero ahora, gracias a modernas técnicas moleculares, las muestras de
suelos pueden ser analizadas de manera directa.
Algunas de estas técnicas han sido recientemente mejoradas como
parte de las actividades de investigación del proyecto financiado por la
Unión Europea «Nanosims enabled approach to understand bacterial and
fungal cellulose degraders in soils» (SAE_SNSP_UVA). En concreto, los
investigadores fueron capaces de extraer componentes de las muestras lo
suficientemente pequeños para permitir la secuenciación del genoma de
una única célula empleando técnicas avanzadas.
Como prueba de concepto para su nueva metodología de extracción, los
investigadores aplicaron esta técnica para la detección de
microorganismos degradadores de la celulosa presentes en el suelo de un
hayedo en Austria. En concreto, estos emplearon estudios biogeoquímicos,
moleculares y enzimáticos para caracterizar diferentes grupos de estos
microorganismos.
Uno de los mayores descubrimientos fue que la adición de glucosa a
las muestra provocó un cambio a favor de las bacterias en la comunidad
microbiana, mientras que la adición de nitrógeno inorgánico favoreció a
los hongos.
En conjunto, el proyecto SAE_SNSP_UVA ha contribuido a mejorar el
conocimiento tanto de la degradación de la celulosa como de los factores
implicados en este proceso. Dado que los suelos contienen las mayores
reservas de carbono en la Tierra, es importante obtener una mejor
comprensión de su papel en el ciclo del carbono terrestre.
publicado: 2015-02-24